在刑事案件重新鉴定过程中，常见的问题包括鉴定机构选择不当、鉴定标准不统一、鉴定材料不完整或污染、鉴定人员专业水平参差不齐等。这些问题可能导致鉴定结果出现偏差，甚至引发争议，影响案件的公正审理。此外，重新鉴定程序启动条件不明确、周期过长、费用高昂等问题也增加了司法实践中的困难。针对这些问题，应当从完善鉴定机构准入机制、统一鉴定技术标准、加强鉴定材料管理、提升鉴定人员专业素养等方面入手，同时优化重新鉴定程序，明确启动条件，缩短鉴定周期，合理控制费用，以确保重新鉴定工作的科学性、公正性和高效性。